يدير طوباس مجلس بلدي تم تأسيسه عام 1953، حيث كان أول رئيس للمجلس الحاج سعد محمد جابر وفي عام 1972 جرت أول انتخابات بلدية في ظل الاحتلال الإسرائيلي حيث فاز برئاسة البلدية السيد هاشم سليمان دراغمة واستمر رئيساً للبلدية حتى عام 1996.

تتمثل رسالة البلدية في استمرار المساهمة في تطوير المجتمع المحلي ورفع مستوى معيشته وذلك عن طريق خلق مناخ سليم وصحي وتوفير الحد الأدنى من متطلبات الحياة ، وبالتالي ضمن ما يتوفر من إمكانيات ، يقوم المجلس البلدي بتقديم خدماته الأساسية للسكان ( المياه ، الكهرباء ، النفايات ، صيانة وتعبيد الشوارع ، وترميم بناء المدارس ، تنظيم عمليات البناء ، وإصدار رخص الحرف والصناعات ) .

يسعى المجلس البلدي ومن خلال إيمانه بدوره الرئيس في رفع مستوى الخدمات التي تقدمها إلى السكان 

حتى يتسنى للجميع التنسيق والتعاون والمشاركة الفاعلة في تحقيق أهداف وتطلعات البلدية تم تحديد الدوائر والأقسام التي تكون هيكلية المجلس مع وضع الصلاحيات والمسؤوليات وإظهار العلاقات التنفيذية والإدارية لكل قسم .

جرت اول انتخابات بلدية طوباس بتاريخ 23/12/2004 في ظل السلطة الوطنية الفلسطينية حيث تم انتخاب مجلس بلدية طوباس من خمسة عشر عضواً برئاسة السيد عقاب نجي دراغمة. وقد أجريت ثاني انتخابات بلدية طوباس بتاريخ 20/10/2012 حيث تم انتخاب مجلس بلدية طوباس الجديد من خمسة عشر عضواً وقد أعيد انتخاب السيد عقاب نجي دراغمة رئيساً للبلدية لمرة ثانية .

تتمثل انجازات بلدية طوباس بالنقاط الأتية:-

العلاقات العامه والدوليه

شاركت بلدية طوباس من خلال الرئيس والأعضاء والموظفين في عدة مؤتمرات دولية في أمريكيا،